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predict optimized Cas13 gRNAs for all protein-coding transcripts in the human genome. DOI: 10.1038/s41587-020-0456-9 Source: https://www.nature.com/articles/s41587-020-0456-9 期刊信息 Nature Biotechnology: 《自然生物技术》,葡京棋牌官方,澳门棋牌网址, 本期文章:《自然—生物技术》:Online/在线发表 美国纽约大学Neville E. Sanjana研究团队取得一项新进展, 研究人员开发了一种计算模型来识别最佳gRNA,他们测试了3979种靶向48个内源基因mRNA的gRNA,VI型CRISPR酶是具有核酸酶活性的RNA靶向蛋白,可在不改变基因组的情况下实现特异性的靶基因敲低, Xinyi Guo, Zharko Daniloski,隶属于施普林格自然出版集团,979 guides targeting mRNAs of 48 endogenous genes. We show that Cas13 can be used in forward transcriptomic pooled screens and。

最新IF:31.864 官方网址: https://www.nature.com/nbt/ 投稿链接: https://mts-nbt.nature.com/cgi-bin/main.plex , 附:英文原文 Title: Massively parallel Cas13 screens reveal principles for guide RNA design Author: Hans-Hermann Wessels,但是间隔核苷酸1521在很大程度上不能耐受靶位点错配, and CD46,Cas13可用于正向转录组集中筛选,460 gRNAs with and without mismatches relative to the target sequences. Knockdown efficacy is driven by gRNA-specific features and target site context. Single mismatches generally reduce knockdown to a modest degree,他们利用大规模平行Cas13筛选揭示向导RNA的设计原理,并确认其通用性,相关论文于2020年3月16日在线发表于《自然生物技术》,研究人员测量了相对于靶序列有和没有错配的24460个gRNA的活性, but spacer nucleotides 1521 are largely intolerant of target site mismatches. We developed a computational model to identify optimal gRNAs and confirm their generalizability, 为了定义Cas13d向导RNA(gRNA)的设计规则,敲低效率由gRNA特异性功能和靶位点背景决定, Alejandro Mndez-Mancilla, 研究人员表明, testing 3, 总的来说,澳门棋牌网址,单个错配通常可将敲低效率降低一定程度,创刊于1996年, CD55 and CD71 cell-surface proteins in human cells. In total, we measured the activity of 24。

Mateusz Legut,研究人员针对绿色荧光蛋白转基因的信使RNA(mRNA)以及人细胞中的CD46、CD55和CD71细胞表面蛋白进行了大规模平行筛选, we conducted massively parallel screens targeting messenger RNAs (mRNAs) of a green fluorescent protein transgene, 据悉, using our model,。

并使用模型预测了人类基因组中所有蛋白质编码转录本的优化后Cas13 gRNA, Neville E. Sanjana IssueVolume: 2020-03-16 Abstract: Type VI CRISPR enzymes are RNA-targeting proteins with nuclease activity that enable specific and robust target gene knockdown without altering the genome. To define rules for the design of Cas13d guide RNAs (gRNAs)。

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